Projects

Avustralya - Queensland University of Technology (QUT)   ile iş birliği kapsamında Dr. Adi Idris ile birlikte, Kırım Kongo Kanamalı Ateşi virüsüne karşı dünyada ilk kez geliştirilen küçük RNA moleküllerinin antiviral etkilerinin araştırılmasına yönelik proje başlatılmıştır. Virüsün üremesini durduğu belirlenen bu moleküllerin klinik araştırmalara ilerlemesi için çalışmalar devam etmektedir. 

In collaboration with Dr. Adi Idris from the Queensland University of Technology (QUT) in Australia, KUISCID launched a groundbreaking project to investigate the antiviral effects of small RNA molecules against the Crimean-Congo Hemorrhagic Fever (CCHF) virus. This research marks the first time such molecules have been developed globally for this purpose. Since studies have already shown that these molecules stop the virus from replicating, work is now continuing to advance them toward clinical trials.

EUCAST çalışmaları kapsamında; EUCAST Geliştirme Laboratuvarı ve Clinical Microbiology, Central Hospital, Växjö, İsveç’te çalışmalarını sürdüren Doç. Dr. Onur Karatuna ile yürütülen iş birliği ile, antibiyotik direnci ve antibiyotik tüketimine ilişkin verilerin standartlaştırılması ve uluslararası karşılaştırılabilirliğinin artırılmasına yönelik ortak bilimsel çıktılar üretilmiştir.

In collaboration with Assoc. Prof. Onur Karatuna  at the EUCAST Development Laboratory and Central Hospital in Växjö, Sweden, KUISCID produced scientific outputs to standardize data on antibiotic resistance and consumption. This partnership aims to enhance the international comparability of research findings within the framework of EUCAST initiatives.

Zürich Üniversitesi ile iş birliği kapsamında başlatılan bir başka projede hastanelerde görülen çok ilaca dirençli bakteri salgınlarının gerçek zamanlı olarak saptanmasına yönelik yapay zekâ tabanlı bir platform geliştirilmektedir. Proje, tüm genom dizileme (WGS), MALDI-TOF kütle spektrometrisi ve epidemiyolojik meta-verilerin entegrasyonu yoluyla, bulaş kümelerinin hızlı ve doğru biçimde tespit edilmesini amaçlamaktadır. Proje ayrıca antimikrobiyal direnç, virülans ve klinik sonuçlarla ilişkili tüm verilerin bütüncül analizini ve açık kaynaklı platformlarda veri setlerinin paylaşımını hedeflemektedir.

In another project launched in collaboration with the University of Zurich, KUISCID is developing an AI-based platform to detect multi-drug resistant bacterial outbreaks in hospitals in real-time. By integrating Whole Genome Sequencing (WGS), MALDI-TOF mass spectrometry, and epidemiological metadata, the project aims to identify transmission clusters rapidly and accurately. Additionally, the initiative focuses on the holistic analysis of data related to antimicrobial resistance, virulence, and clinical outcomes, while sharing these datasets on open-source platforms.

Philipps University Marburg ile iş birliği kapsamında planlanan “Kırım Kongo Kanamalı Ateşi Enfeksiyonu sırasında Tetiklenen Hücresel ve Hücre Dışı Bağışıklıktaki Değişiklikler” başlıklı çalışma TÜBİTAK ve Almanya Araştırma Konseyi (DFG) tarafından desteklenmeye hak kazandı. Bu çalışmada Kırım Kongo Kanamalı Ateşi enfeksiyonunda hücresel bağışıklık ynıtlarını, ekstrasellüler veziküllerin (EV) patogenezdeki rolü ve hastalık sonrası uzun dönem etkilerinin  incelenmesi amaçlanmaktadır. 

In collaboration with Philipps University Marburg, the study titled "Changes in Cellular and Extracellular Immunity Triggered During Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Infection" received funding from TÜBİTAK and the German Research Foundation (DFG). This research aims to investigate cellular immune responses, the role of extracellular vesicles (EV) in pathogenesis, and the long-term effects of the disease.

Arkeogenetik (antik DNA) projeleri üzerine Kanada McMaster Üniversitesi’nden Dr. Hendrik Poinar ile ortak çalışmalar başlatılmıştır. Antik patojen ile DNA laboratuvar çalışmaları ve biyoinformatik analizler alanlarında iş birliği yapılmaktadır. Söz konusu iş birliği kapsamında, deneysel araştırmaların yürütülmesi ile araştırmacı değişim programlarının gerçekleştirilmesi planlanmaktadır.

In collaboration with Dr. Hendrik Poinar from McMaster University in Canada, KUISCID has initiated joint projects on archaeogenetics (ancient DNA). This partnership focuses on laboratory studies of ancient pathogen DNA and advanced bioinformatics analysis. The collaboration includes conducting experimental research and implementing research exchange programs to further scientific expertise in this field.